La competencia del Tribunal de Justicia Administrativa del Poder Judicial del Estado de Puebla, abarca la imposición de sanciones a servidores públicos por faltas administrativas graves, así como a particulares vinculados con las mismas, de conformidad a lo que establece la Ley General de Responsabilidades Administrativas en relación al Sistema Estatal Anticorrupción.

Por otra parte, el Tribunal tiene competencia para conocer de los juicios que promuevan los particulares en contra de actos y resoluciones de la administración pública del Estado y de los 217 municipios, cuando consideren que dichas autoridades no han actuado conforme a derecho.